Untuk mencapai tujuan penelitian STIQSI seperti dalam RIP STIQSI 2017-2027, dirumuskan fungsi dan sasaran program kerja LPPM adalah sebagai berikut:
- Mengembangkan budaya penelitian multidisiplin dengan memacu inovasi ilmu pengetahuan yang bermanfaat bagi kepentingan bangsa, negara, dan kemanusiaan.
- Memperkuat etika dan integritas sumber daya manusia STIQSI serta memperkuat kemampuan mengelola dan berkontribusi dalam penelitian, untuk menopang kepemimpinan, kemanfaatan, kesempurnaan proses, kematangan, keunggulan organisasi dan tata kelola, dan keterpercayaan STIQSI.
- Memperkuat sistem, organisasi, dan tata kelola penelitian dengan menjalankan reformasi birokrasi untuk menciptakan layanan prima dalam bidang penelitian serta penguatan sistem inovasi dalam menjalankan penelitian, meningkatkan kepercayaan pemangku kepentingan (stakeholders), dan memberikan fasilitas bagi dosen dan para peneliti serta jaminan kesejahteraan berdasarkan birokrasi yang bersih dan bebas korupsi, kolusi, dan nepotisme.
- Meningkatkan kemampuan pendanaan penelitian dengan melibatkan pemangku kepentingan eksternal dengan memperkuat dan mengembangkan kerjasama nasional dan internasional untuk peningkatan infrastruktur penelitian, reformasi pendanaan, dan perbaikan mutu dan infrastruktur penyelenggaraan penelitian.